ideogram/test/cli-test.js

Chromosome visualization for the web

/* eslint-disable max-len */

// var assert = require('chai').assert;
// var exec = require('child_process').exec;
// var fs = require('fs');

// describe("Ideogram CLI", function() {

//   it("should run the built-in example", function(done) {

//     this.timeout(30000);
//     var numImages = 100;

//     var cmd =
//     'ideogram ' +
//       '--taxid 9606 ' +
//       '--chromosomes 1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,22,X,Y ' +
//       '--chr-width 10 ' +
//       '--chr-height 500 ' +
//       '--chr-margin 10 ' +
//       '--show-band-labels true ' +
//       '--show-chromosome-labels true ' +
//       '--orientation horizontal ' +
//       '--local-annotations-path data/annotations/' + numImages + '_virtual_snvs.json';

//     console.log("Ideogram CLI test command:")
//     console.log(cmd)

//     exec(cmd, function(error, stdout, stderr) {
//       var images = fs.readdirSync('images');
//       assert.equal(numImages, images.length);
//       done();
//     })

//   });

// });