ideogram
Version:
Chromosome visualization for the web
426 lines (425 loc) • 16.9 kB
text/tab-separated-values
#chromosome arm band iscn_start iscn_stop bp_start bp_stop stain density
1 p ter 0 1 0 1 gneg
1 q A1 1 18 2 8918386 gpos 100
1 q A2 18 25 8918387 12386647 gneg
1 q A3 25 41 12386648 20314102 gpos 33
1 q A4 41 45 20314103 22295965 gneg
1 q A5 45 63 22295966 31214352 gpos 100
1 q B 63 88 31214353 43601000 gneg
1 q C1.1 88 111 43601001 54996715 gpos 66
1 q C1.2 111 114 54996716 56483113 gneg
1 q C1.3 114 121 56483114 59951375 gpos 75
1 q C2 121 133 59951376 65896965 gneg
1 q C3 133 152 65896966 75310818 gpos 33
1 q C4 152 163 75310819 80760943 gneg
1 q C5 163 178 80760944 88192931 gpos 33
1 q D 178 203 88192932 100579579 gneg
1 q E1.1 203 209 100579580 103552375 gpos 33
1 q E1.2 209 211 103552376 104543306 gneg
1 q E2.1 211 229 104543307 113461693 gpos 100
1 q E2.2 229 232 113461694 114948091 gneg
1 q E2.3 232 256 114948092 126839272 gpos 100
1 q E3 256 262 126839273 129812068 gneg
1 q E4 262 284 129812069 140712318 gpos 66
1 q F 284 300 140712319 148639772 gneg
1 q G1 300 309 148639773 153098966 gpos 100
1 q G2 309 311 153098967 154089897 gneg
1 q G3 311 320 154089898 158549091 gpos 100
1 q H1 320 326 158549092 161521886 gneg
1 q H2.1 326 334 161521887 165485613 gpos 33
1 q H2.2 334 337 165485614 166972011 gneg
1 q H2.3 337 346 166972012 171431204 gpos 33
1 q H3 346 358 171431205 177376795 gneg
1 q H4 358 370 177376796 183322386 gpos 33
1 q H5 370 383 183322387 189763443 gneg
1 q H6 383 398 189763444 197195432 gpos 33
2 p ter 0 1 0 1 gneg
2 q A1 1 30 2 14052687 gpos 100
2 q A2 30 35 14052688 16394801 gneg
2 q A3 35 62 16394802 29042220 gpos 33
2 q B 62 103 29042221 48247559 gneg
2 q C1.1 103 129 48247560 60426554 gpos 100
2 q C1.2 129 130 60426555 60894977 gneg
2 q C1.3 130 146 60894978 68389744 gpos 100
2 q C2 146 153 68389745 71668704 gneg
2 q C3 153 173 71668705 81037162 gpos 66
2 q D 173 189 81037163 88531928 gneg
2 q E1 189 216 88531929 101179347 gpos 100
2 q E2 216 224 101179348 104926730 gneg
2 q E3 224 241 104926731 112889920 gpos 33
2 q E4 241 247 112889921 115700457 gneg
2 q E5 247 264 115700458 123663646 gpos 66
2 q F1 264 281 123663647 131626836 gneg
2 q F2 281 287 131626837 134437373 gpos 33
2 q F3 287 301 134437374 140995294 gneg
2 q G1 301 313 140995295 146616369 gpos 100
2 q G2 313 315 146616370 147553214 gneg
2 q G3 315 325 147553215 152237444 gpos 100
2 q H1 325 339 152237445 158795364 gneg
2 q H2 339 348 158795365 163011170 gpos 33
2 q H3 348 370 163011171 173316474 gneg
2 q H4 370 388 173316475 181748087 gpos 33
3 p ter 0 1 0 1 gneg
3 q A1 1 38 2 18490218 gpos 100
3 q A2 38 42 18490219 20436557 gneg
3 q A3 42 73 20436558 35520683 gpos 66
3 q B 73 96 35520684 46712131 gneg
3 q C 96 116 46712132 56443825 gpos 100
3 q D 116 125 56443826 60823088 gneg
3 q E1 125 143 60823089 69581612 gpos 33
3 q E2 143 149 69581613 72501120 gneg
3 q E3 149 172 72501121 83692569 gpos 100
3 q F1 172 191 83692570 92937678 gneg
3 q F2.1 191 200 92937679 97316940 gpos 33
3 q F2.2 200 218 97316941 106075465 gneg
3 q F2.3 218 222 106075466 108021804 gpos 33
3 q F3 222 236 108021805 114833990 gneg
3 q G1 236 260 114833991 126512023 gpos 100
3 q G2 260 264 126512024 128458361 gneg
3 q G3 264 284 128458362 138190056 gpos 66
3 q H1 284 295 138190057 143542487 gneg
3 q H2 295 304 143542488 147921750 gpos 33
3 q H3 304 316 147921751 153760766 gneg
3 q H4 316 328 153760767 159599783 gpos 33
4 p ter 0 1 0 1 gneg
4 q A1 1 31 2 14799183 gpos 100
4 q A2 31 37 14799184 17663541 gneg
4 q A3 37 59 17663542 28166187 gpos 100
4 q A4 59 63 28166188 30075759 gneg
4 q A5 63 91 30075760 43442763 gpos 66
4 q B1 91 108 43442764 51558444 gneg
4 q B2 108 115 51558445 54900195 gpos 33
4 q B3 115 132 54900196 63015876 gneg
4 q C1 132 145 63015877 69221985 gpos 33
4 q C2 145 150 69221986 71608950 gneg
4 q C3 150 175 71608951 83543776 gpos 100
4 q C4 175 187 83543777 89272492 gneg
4 q C5 187 203 89272493 96910780 gpos 66
4 q C6 203 220 96910781 105026461 gneg
4 q C7 220 231 105026462 110277784 gpos 66
4 q D1 231 245 110277785 116961286 gneg
4 q D2.1 245 251 116961287 119825644 gpos 33
4 q D2.2 251 273 119825645 130328290 gneg
4 q D2.3 273 279 130328291 133192648 gpos 33
4 q D3 279 295 133192649 140830936 gneg
4 q E1 295 308 140830937 147037045 gpos 100
4 q E2 308 326 147037046 155630120 gneg
5 p ter 0 1 0 1 gneg
5 q A1 1 31 2 14964098 gpos 100
5 q A2 31 34 14964099 16412236 gneg
5 q A3 34 53 16412237 25583780 gpos 66
5 q B1 53 70 25583781 33789899 gneg
5 q B2 70 74 33789900 35720750 gpos 33
5 q B3 74 105 35720751 50684848 gneg
5 q C1 105 122 50684849 58890967 gpos 33
5 q C2 122 127 58890968 61304531 gneg
5 q C3.1 127 149 61304532 71924213 gpos 100
5 q C3.2 149 153 71924214 73855065 gneg
5 q C3.3 153 162 73855066 78199480 gpos 66
5 q D 162 170 78199481 82061183 gneg
5 q E1 170 190 82061184 91715440 gpos 100
5 q E2 190 195 91715441 94129004 gneg
5 q E3 195 207 94129005 99921558 gpos 33
5 q E4 207 212 99921559 102335123 gneg
5 q E5 212 224 102335124 108127677 gpos 33
5 q F 224 260 108127678 125505339 gneg
5 q G1.1 260 264 125505340 127436191 gpos 33
5 q G1.2 264 266 127436192 128401616 gneg
5 q G1.3 266 272 128401617 131297893 gpos 33
5 q G2 272 304 131297894 146744704 gneg
5 q G3 304 316 146744705 152537259 gpos 33
6 p ter 0 1 0 1 gneg
6 q A1 1 34 2 16613004 gpos 100
6 q A2 34 44 16613005 21499181 gneg
6 q A3.1 44 56 21499182 27362595 gpos 100
6 q A3.2 56 58 27362596 28339830 gneg
6 q A3.3 58 70 28339831 34203243 gpos 100
6 q B1 70 85 34203244 41532510 gneg
6 q B2.1 85 91 41532511 44464216 gpos 66
6 q B2.2 91 94 44464217 45930070 gneg
6 q B2.3 94 104 45930071 50816247 gpos 66
6 q B3 104 128 50816248 62543074 gneg
6 q C1 128 152 62543075 74269900 gpos 100
6 q C2 152 157 74269901 76712989 gneg
6 q C3 157 176 76712990 85996727 gpos 66
6 q D1 176 193 85996728 94303229 gneg
6 q D2 193 196 94303230 95769082 gpos 33
6 q D3 196 211 95769083 103098349 gneg
6 q E1 211 222 103098350 108473144 gpos 100
6 q E2 222 224 108473145 109450380 gneg
6 q E3 224 239 109450381 116779646 gpos 100
6 q F1 239 251 116779647 122643059 gneg
6 q F2 251 256 122643060 125086148 gpos 33
6 q F3 256 270 125086149 131926797 gneg
6 q G1 270 285 131926798 139256063 gpos 66
6 q G2 285 292 139256064 142676388 gneg
6 q G3 292 306 142676389 149517037 gpos 33
7 p ter 0 1 0 1 gneg
7 q A1 1 30 2 15943333 gpos 100
7 q A2 30 36 15943334 19131999 gneg
7 q A3 36 56 19132000 29760888 gpos 33
7 q B1 56 68 29760889 36138221 gneg
7 q B2 68 74 36138222 39326888 gpos 33
7 q B3 74 94 39326889 49955776 gneg
7 q B4 94 107 49955777 56864554 gpos 33
7 q B5 107 120 56864555 63773332 gneg
7 q C 120 141 63773333 74933665 gpos 100
7 q D1 141 152 74933666 80779554 gneg
7 q D2 152 159 80779555 84499665 gpos 66
7 q D3 159 178 84499666 94597109 gneg
7 q E1 178 197 94597110 104694553 gpos 100
7 q E2 197 202 104694554 107351775 gneg
7 q E3 202 220 107351776 116917775 gpos 33
7 q F1 220 234 116917776 124357997 gneg
7 q F2 234 243 124357998 129140997 gpos 33
7 q F3 243 271 129140998 144021442 gneg
7 q F4 271 278 144021443 147741553 gpos 33
7 q F5 278 287 147741554 152524553 gneg
8 p ter 0 1 0 1 gneg
8 q A1.1 1 34 2 16228701 gpos 100
8 q A1.2 34 36 16228702 17183331 gneg
8 q A1.3 36 43 17183332 20524534 gpos 33
8 q A2 43 63 20524535 30070829 gneg
8 q A3 63 72 30070830 34366662 gpos 33
8 q A4 72 94 34366663 44867586 gneg
8 q B1.1 94 103 44867587 49163419 gpos 66
8 q B1.2 103 107 49163420 51072678 gneg
8 q B1.3 107 119 51072679 56800455 gpos 66
8 q B2 119 127 56800456 60618973 gneg
8 q B3.1 127 143 60618974 68256009 gpos 100
8 q B3.2 143 145 68256010 69210638 gneg
8 q B3.3 145 159 69210639 75893045 gpos 100
8 q C1 159 171 75893046 81620822 gneg
8 q C2 171 181 81620823 86393969 gpos 33
8 q C3 181 192 86393970 91644432 gneg
8 q C4 192 195 91644433 93076376 gpos 33
8 q C5 195 204 93076377 97372209 gneg
8 q D1 204 220 97372210 105009245 gpos 100
8 q D2 220 222 105009246 105963874 gneg
8 q D3 222 236 105963875 112646281 gpos 33
8 q E1 236 264 112646282 126011094 gneg
8 q E2 264 276 126011095 131738871 gpos 33
9 p ter 0 1 0 1 gneg
9 q A1 1 31 2 14352094 gpos 100
9 q A2 31 42 14352095 19444773 gneg
9 q A3 42 52 19444774 24074481 gpos 33
9 q A4 52 82 24074482 37963604 gneg
9 q A5.1 82 95 37963605 43982225 gpos 66
9 q A5.2 95 100 43982226 46297079 gneg
9 q A5.3 100 118 46297080 54630553 gpos 66
9 q B 118 136 54630554 62964027 gneg
9 q C 136 150 62964028 69445618 gpos 33
9 q D 150 167 69445619 77316122 gneg
9 q E1 167 178 77316123 82408800 gpos 33
9 q E2 178 182 82408801 84260683 gneg
9 q E3.1 182 196 84260684 90742275 gpos 100
9 q E3.2 196 197 90742276 91205245 gneg
9 q E3.3 197 217 91205246 100464661 gpos 100
9 q E4 217 219 100464662 101390603 gpos 66
9 q F1 219 233 101390604 107872194 gneg
9 q F2 233 239 107872195 110650019 gpos 33
9 q F3 239 258 110650020 119446464 gneg
9 q F4 258 268 119446465 124076172 gpos 33
10 p ter 0 1 0 1 gneg
10 q A1 1 26 2 12754055 gpos 100
10 q A2 26 36 12754056 17659461 gneg
10 q A3 36 48 17659462 23545948 gpos 33
10 q A4 48 68 23545949 33356759 gneg
10 q B1 68 84 33356760 41205409 gpos 100
10 q B2 84 98 41205410 48072977 gneg
10 q B3 98 114 48072978 55921626 gpos 100
10 q B4 114 130 55921627 63770276 gneg
10 q B5.1 130 138 63770277 67694600 gpos 100
10 q B5.2 138 139 67694601 68185141 gneg
10 q B5.3 139 152 68185142 74562168 gpos 100
10 q C1 152 181 74562169 88787845 gneg
10 q C2 181 195 88787846 95655414 gpos 33
10 q C3 195 201 95655415 98598657 gneg
10 q D1 201 227 98598658 111352712 gpos 100
10 q D2 227 253 111352713 124106767 gneg
10 q D3 253 265 124106768 129993255 gpos 33
11 p ter 0 1 0 1 gneg
11 q A1 1 28 2 13021480 gpos 100
11 q A2 28 37 13021481 17206956 gneg
11 q A3.1 37 47 17206957 21857485 gpos 100
11 q A3.2 47 55 21857486 25577908 gneg
11 q A3.3 55 65 25577909 30228437 gpos 100
11 q A4 65 78 30228438 36274125 gneg
11 q A5 78 93 36274126 43249918 gpos 100
11 q B1.1 93 103 43249919 47900447 gneg
11 q B1.2 103 107 47900448 49760658 gpos 33
11 q B1.3 107 129 49760659 59991822 gneg
11 q B2 129 135 59991823 62782139 gpos 33
11 q B3 135 152 62782140 70688038 gneg
11 q B4 152 159 70688039 73943408 gpos 33
11 q B5 159 176 73943409 81849307 gneg
11 q C 176 194 81849308 90220259 gpos 100
11 q D 194 220 90220260 102311634 gneg
11 q E1 220 237 102311635 110217533 gpos 66
11 q E2 237 262 110217534 121843856 gneg
12 p ter 0 1 0 1 gneg
12 q A1.1 1 40 2 17766671 gpos 100
12 q A1.2 40 48 17766672 21320005 gneg
12 q A1.3 48 59 21320006 26205839 gpos 66
12 q A2 59 72 26205840 31980007 gneg
12 q A3 72 89 31980008 39530843 gpos 33
12 q B1 89 100 39530844 44416677 gneg
12 q B2 100 102 44416678 45305011 gpos 33
12 q B3 102 118 45305012 52411679 gneg
12 q C1 118 150 52411680 66625016 gpos 100
12 q C2 150 162 66625017 71955017 gneg
12 q C3 162 184 71955018 81726686 gpos 100
12 q D1 184 194 81726687 86168354 gneg
12 q D2 194 201 86168355 89277522 gpos 33
12 q D3 201 217 89277523 96384190 gneg
12 q E 217 241 96384191 107044193 gpos 100
12 q F1 241 260 107044194 115483361 gneg
12 q F2 260 273 115483362 121257530 gpos 66
13 p ter 0 1 0 1 gneg
13 q A1 1 33 2 16267960 gpos 100
13 q A2 33 43 16267961 21197645 gneg
13 q A3.1 43 60 21197646 29578109 gpos 66
13 q A3.2 60 67 29578110 33028888 gneg
13 q A3.3 67 84 33028889 41409353 gpos 33
13 q A4 84 90 41409354 44367164 gneg
13 q A5 90 107 44367165 52747628 gpos 33
13 q B1 107 120 52747629 59156219 gneg
13 q B2 120 125 59156220 61621061 gpos 33
13 q B3 125 141 61621062 69508557 gneg
13 q C1 141 159 69508558 78381990 gpos 33
13 q C2 159 164 78381991 80846832 gneg
13 q C3 164 192 80846833 94649950 gpos 100
13 q D1 192 216 94649951 106481194 gneg
13 q D2.1 216 224 106481195 110424942 gpos 33
13 q D2.2 224 236 110424943 116340564 gneg
13 q D2.3 236 244 116340565 120284312 gpos 33
14 p ter 0 1 0 1 gneg
14 q A1 1 30 2 15023383 gpos 100
14 q A2 30 39 15023384 19530398 gneg
14 q A3 39 60 19530399 30046767 gpos 33
14 q B 60 87 30046768 43567812 gneg
14 q C1 87 104 43567813 52081063 gpos 100
14 q C2 104 110 52081064 55085740 gneg
14 q C3 110 120 55085741 60093534 gpos 66
14 q D1 120 138 60093535 69107564 gneg
14 q D2 138 146 69107565 73113800 gpos 33
14 q D3 146 170 73113801 85132507 gneg
14 q E1 170 178 85132508 89138743 gpos 66
14 q E2.1 178 198 89138744 99154332 gpos 100
14 q E2.2 198 200 99154333 100155891 gneg
14 q E2.3 200 215 100155892 107667583 gpos 100
14 q E3 215 222 107667584 111173039 gneg
14 q E4 222 242 111173040 121188628 gpos 100
14 q E5 242 250 121188629 125194864 gneg
15 p ter 0 1 0 1 gneg
15 q A1 1 36 2 16413299 gpos 100
15 q A2 36 53 16413300 24164024 gneg
15 q B1 53 65 24164025 29635124 gpos 33
15 q B2 65 70 29635125 31914749 gneg
15 q B3.1 70 94 31914750 42856949 gpos 100
15 q B3.2 94 98 42856950 44680649 gneg
15 q B3.3 98 109 44680650 49695824 gpos 66
15 q C 109 117 49695825 53343224 gneg
15 q D1 117 145 53343225 66109124 gpos 100
15 q D2 145 150 66109125 68388749 gneg
15 q D3 150 169 68388750 77051324 gpos 66
15 q E1 169 183 77051325 83434274 gneg
15 q E2 183 190 83434275 86625749 gpos 33
15 q E3 190 209 86625750 95288324 gneg
15 q F1 209 221 95288325 100759424 gpos 66
15 q F2 221 223 100759425 101671274 gneg
15 q F3 223 227 101671275 103494974 gpos 33
16 p ter 0 1 0 1 gneg
16 q A1 1 33 2 15450152 gpos 100
16 q A2 33 35 15450153 16386525 gneg
16 q A3 35 44 16386526 20600202 gpos 33
16 q B1 44 56 20600203 26218440 gneg
16 q B2 56 69 26218441 32304863 gpos 33
16 q B3 69 82 32304864 38391287 gneg
16 q B4 82 96 38391288 44945897 gpos 33
16 q B5 96 115 44945898 53841439 gneg
16 q C1.1 115 124 53841440 58055117 gpos 66
16 q C1.2 124 126 58055118 58991490 gneg
16 q C1.3 126 143 58991491 66950659 gpos 66
16 q C2 143 151 66950660 70696150 gneg
16 q C3.1 151 169 70696151 79123506 gpos 100
16 q C3.2 169 170 79123507 79591692 gneg
16 q C3.3 170 196 79591693 91764540 gpos 100
16 q C4 196 210 91764541 98319150 gneg
17 p ter 0 1 0 1 gneg
17 q A1 1 32 2 13984976 gpos 100
17 q A2 32 37 13984977 16170128 gneg
17 q A3.1 37 40 16170129 17481220 gpos 33
17 q A3.2 40 50 17481221 21851525 gneg
17 q A3.3 50 72 21851526 31466196 gpos 66
17 q B1 72 92 31466197 40206806 gneg
17 q B2 92 95 40206807 41517898 gpos 33
17 q B3 95 105 41517899 45888203 gneg
17 q C 105 128 45888204 55939905 gpos 66
17 q D 128 138 55939906 60310210 gneg
17 q E1.1 138 156 60310211 68176759 gpos 100
17 q E1.2 156 158 68176760 69050820 gneg
17 q E1.3 158 168 69050821 73421125 gpos 100
17 q E2 168 180 73421126 78665491 gneg
17 q E3 180 190 78665492 83035796 gpos 33
17 q E4 190 204 83035797 89154223 gneg
17 q E5 204 218 89154224 95272651 gpos 33
18 p ter 0 1 0 1 gneg
18 q A1 1 46 2 19420992 gpos 100
18 q A2 46 70 19420993 29553684 gneg
18 q B1 70 84 29553685 35464421 gpos 66
18 q B2 84 88 35464422 37153203 gneg
18 q B3 88 108 37153204 45597113 gpos 100
18 q C 108 118 45597114 49819068 gneg
18 q D1 118 128 49819069 54041023 gpos 100
18 q D2 128 129 54041024 54463218 gneg
18 q D3 129 144 54463219 60796150 gpos 100
18 q E1 144 161 60796151 67973474 gneg
18 q E2 161 178 67973475 75150797 gpos 33
18 q E3 178 198 75150798 83594707 gneg
18 q E4 198 215 83594708 90772031 gpos 33
19 p ter 0 1 0 1 gneg
19 q A 1 41 2 16655891 gpos 100
19 q B 41 63 16655892 25593199 gneg
19 q C1 63 86 25593200 34936748 gpos 66
19 q C2 86 94 34936749 38186678 gneg
19 q C3 94 117 38186679 47530227 gpos 66
19 q D1 117 127 47530228 51592639 gneg
19 q D2 127 145 51592640 58904982 gpos 33
19 q D3 145 151 58904983 61342430 gneg
X p ter 0 1 0 1 gneg
X q A1.1 1 32 2 15368327 gpos 100
X q A1.2 32 37 15368328 17769628 gneg
X q A1.3 37 43 17769629 20651189 gpos 33
X q A2 43 57 20651190 27374832 gneg
X q A3.1 57 68 27374833 32657694 gpos 66
X q A3.2 68 70 32657695 33618215 gneg
X q A3.3 70 81 33618216 38901077 gpos 66
X q A4 81 97 38901078 46585241 gneg
X q A5 97 114 46585242 54749664 gpos 66
X q A6 114 128 54749665 61473308 gneg
X q A7.1 128 141 61473309 67716690 gpos 66
X q A7.2 141 144 67716691 69157471 gneg
X q A7.3 144 157 69157472 75400854 gpos 66
X q B 157 167 75400855 80203456 gneg
X q C1 167 185 80203457 88848140 gpos 100
X q C2 185 187 88848141 89808660 gneg
X q C3 187 205 89808661 98453344 gpos 100
X q D 205 223 98453345 107098028 gneg
X q E1 223 244 107098029 117183493 gpos 100
X q E2 244 246 117183494 118144013 gneg
X q E3 246 274 118144014 131591300 gpos 100
X q F1 274 287 131591301 137834682 gneg
X q F2 287 302 137834683 145038586 gpos 33
X q F3 302 317 145038587 152242489 gneg
X q F4 317 332 152242490 159446392 gpos 33
X q F5 332 347 159446393 166650296 gneg
Y p ter 0 1 0 1 gneg
Y q A1 1 36 2 3578074 gpos 100
Y q A2 36 57 3578075 5665285 gpos 66
Y q B 57 79 5665286 7851886 gpos 33
Y q C1 79 95 7851887 9442142 gpos 100
Y q C2 95 108 9442143 10734224 gpos 33
Y q C3 108 126 10734225 12523262 gpos 100
Y q D 126 145 12523263 14411690 gpos 33
Y q E 145 160 14411691 15902555 gpos 66